Outils génétiques pour la conservation de la faune sauvage : vers une gestion fondée sur la science

Section : Zoologie

Nom de l’agent·e responsable : Alain Frantz, Alexander Weigand

Stratégie de recherche : Comprendre et préserver la nature, la société et l'histoire naturelle

La génétique de conservation fournit des outils puissants pour soutenir la gestion des populations d'espèces sauvages fondée sur des données scientifiques. Une analyse de la diversité génétique, de la structure des populations et de l'hybridation, permet d’évaluer l'état de conservation des espèces, d’identifier les populations à risque et de détecter les menaces génétiques telles que la consanguinité ou l'introgression de taxons non indigènes.

En utilisant des approches génétiques et génomiques, ce travail aide à définir les priorités en matière de conservation, à guider les efforts de réintroduction et de translocation, et à informer les décisions politiques et de gestion. L'histoire démographique des populations est également explorée afin de mieux comprendre leur statut actuel et leur résilience. Cette recherche contribue directement au développement d'actions de conservation ciblées et efficaces, fondées sur des preuves scientifiques.

Publications récentes :

Tapolczai, K., Chonova, T., Fidlerová, D., Makovinská, J., Mora, D., Weigand, A., & Zimmermann, J. (2024). Molecular metrics to monitor ecological status of large rivers: Implementation of diatom DNA metabarcoding in the Joint Danube Survey 4. Ecological Indicators, 160, 111883.

Leese, F., Woppowa, L., Bálint, M., Höss, S., Krehenwinkel, H., Lötters, S., ... & Züghart, W. (2023). DNA-basierte Biodiversitätsanalysen im Natur-und Umweltschutz: Welche Optionen haben wir für eine Standardisierung?: eine Handlungsempfehlung aus Forschung und Praxis.

Leese, F., Woppowa, L., Bálint, M., Höss, S., Krehenwinkel, H., Lötters, S., Meissner, K., Nowak, C., Rausch, P., Rduch, V., Rulik, B., Weigand, A. M., Zimmermann, J., Koschorreck, J., Züghart, W., & Naturschutz, B. F. (2025). DNA-based biodiversity analyses in nature conservation and environmental protection: What options do we have for standardisation? https://doi.org/10.19217/skr755

Pont, D., Meulenbroek, P., Bammer, V., Dejean, T., Erős, T., Jean, P., ... & Valentini, A. (2023). Quantitative monitoring of diverse fish communities on a large scale combining eDNA metabarcoding and qPCR. Molecular Ecology Resources, 23(2), 396-409.

Schleimer, A., Frantz, A. C., Richart, L., Mehnert, J., Semiadi, G., Wirdateti, ... & Drygala, F. (2023). Conservation prioritisation through genomic reconstruction of demographic histories applied to two endangered suids in the Malay Archipelago. Diversity and Distributions, 29(6), 713-726.

Blancher, P., Lefrançois, E., Rimet, F., Vasselon, V., Argillier, C., Arle, J., ... & Bouchez, A. (2022). A strategy for successful integration of DNA-based methods in aquatic monitoring. Metabarcoding and Metagenomics, 6, 215-226.

Herrera-Mesías, F., Bause, C., Ogan, S., Burger, H., Ayasse, M., Weigand, A. M., & Eltz, T. (2022). Double-blind validation of alternative wild bee identification techniques: DNA metabarcoding and in vivo determination in the field. Journal of Hymenoptera Research, 93, 189-214.

Herrera-Mesías, F., Jarboui, I. K. E., & Weigand, A. M. (2022). A metabarcoding framework for wild bee assessment in Luxembourg. Journal of Hymenoptera Research, 94, 215-246.

Pawlowski, J., Bruce, K., Panksep, K., Aguirre, F. I., Amalfitano, S., Apothéloz-Perret-Gentil, L., ... & Fazi, S. (2022). Environmental DNA metabarcoding for benthic monitoring: A review of sediment sampling and DNA extraction methods. Science of the Total Environment, 818, 151783.

Schleimer, A., Richart, L., Drygala, F., Casabianca, F., Maestrini, O., Weigand, H., ... & Frantz, A. C. (2022). Introgressive hybridisation between domestic pigs (Sus scrofa domesticus) and endemic Corsican wild boars (S. s. meridionalis): effects of human-mediated interventions. Heredity, 128(4), 279-290.

Weigand, H., Cross Lopez de Llergo, J., & Frantz, A. C. (2022). Genomic basis for an informed conservation management of Pelophylax water frogs in Luxembourg. Ecology and Evolution, 12(4), e8810.

Frantz, A. C., Viglino, A., Wilwert, E., Cruz, A. P., Wittische, J., Weigand, A. M., ... & Pir, J. B. (2022). Conservation by trans-border cooperation: population genetic structure and diversity of Geoffroy’s bat (Myotis emarginatus) at its north-western European range edge. Biodiversity and Conservation, 31(3), 925-948.

Blackman, R. C., Altermatt, F., Foulquier, A., Lefébure, T., Gauthier, M., Bouchez, A., ... & Datry, T. (2021). Unlocking our understanding of intermittent rivers and ephemeral streams with genomic tools. Frontiers in Ecology and the Environment, 19(10), 574-583.

Weigand, A. M., Desquiotz, N., Weigand, H., & Szucsich, N. (2021). Application of propylene glycol in DNA-based studies of invertebrates. Metabarcoding and Metagenomics, 5, e57278.

Drygala, F., Rode-Margono, J., Semiadi, G., Wirdateti, & Frantz, A. C. (2020). Evidence of hybridisation between the common Indonesian banded pig (Sus scrofa vitattus) and the endangered Java warty pig (Sus verrucosus). Conservation Genetics, 21, 1073-1078.